Disciplina detalhes

Conhecimentos de Base Recomendados

-

Objetivos

Pretende-se que os estudantes adquiram competências na área da engenharia genética aplicada à produção de proteínas recombinantes em procariontes e eucariontes, recorrendo a várias ferramentas e técnicas da tecnologia do DNA recombinante e de outras abordagens moleculares e análise in silico e suas aplicações. Pretende-se ainda que os estudantes desenvolvam conhecimentos que permitam a atualização e o progresso na área de aplicação científica da Biotecnologia Molecular.

Métodos de Ensino

Esta UC compreende uma componente teórica/prática. Os conteúdos teóricos são lecionados via apresentações em suporte informático de PowerPoint e são acompanhados por exemplos de aplicação prática que incluem aulas de análise de case studies ou execução de mini-projetos que poderão ser testados em parte em ambiente laboratorial, recorrendo à componente de práticas laboratorais da UC.

Estágio(s)

Não

Programa

-  Estratégias para o melhoramento da produção de proteínas recombinantes. Critérios para a escolha de um sistema de expressão de proteínas heterólogas: Sistemas de expressão em bactérias; Sistemas de expressão em eucariontes: levedura; insetos com baculovírus; mamíferos; vetores víricos para expressão em células de mamíferos; promotores utilizados na construção de vetores de células de mamíferos; sistemas de expressão em plantas (p.e., Agrobacterium).

-  Metodologias para promover a fusão genética e interrupção genética: “one step disruption method” e “PCR-generated short and long flanking homology”. Desenho de primers para fusão, interrupção, mutagénese dirigida e gap repair. Estratégias de clonagem. Regulação genética por RNA de interferência.

-  Análise de sequências in silico. Pesquisa de sequências nucleotídicas. Alinhamento de sequências de DNA ou proteína. Análise in silico da topologia de uma proteína. Análise filogenética de proteínas.

Demonstração de conteúdos

O conteúdo desta UC visa aprofundar alguns dos temas abrangidos pela Engenharia Genética, nomeadamente as metodologias para a produção de proteínas heterólogas em vários tipo de células (procariontes e eucariontes). Para além disso, são lecionados conteúdos de regulação genética, de análises in silico e noções de evolução microbiana, de modo a melhor acompanhar as tendências nesta área multi-disciplinar tão abrangente.

Demonstração da metodologia

As metodologias de ensino incluem aulas teórico/práticas que recorrem a uma estratégia de exposição em sala de aula com o objetivo de passar conceitos, definições e mecanismos de interpretação de problemas de aplicação prática. As metodologias de ensino recorrem ainda a uma estratégia de resolução de exercícios com supervisão do docente.Com as aulas teórico/práticas é pretendido transmitir ao estudante o conhecimento necessário para a persecução dos objetivos da unidade curricular de tal modo que o estudante adquira competências para compreender, descrever e relacionar o conhecimento. As aulas laboratoriais permitem aplicar os conhecimentos numa situação real, consolidando os conhecimentos e melhorando a percepção dos conteúdos apresentados. O regime de avaliação por trabalhos e testes foi estabelecida para uma aferição acompanhada das competências adquiridas, ao longo do semestre. A avaliação por exame final permite também aferir se as competências de integração de conhecimentos foram alcançadas.

Docente(s) responsável(eis)

-

Métodos de Avaliação

Bibliografia

Jeremy W. Dale, Simon F. Park; Molecular Genetics of Bacteria, Wiley Blackwell, 5.ª Edição, 2010
T.A. Brown; Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction, Wiley Blackwell, 6.ª Edição, 2010
G. Gibson, S.V. Muse; A Primer of Genome Science, Sinauer Associates, Inc., 3.ª Edição, 2008
Carlos A. Rosa, Gábor Péter ; The Yeast Handbook – Biodiversity and Ecophysiology of Yeast, Springer Verlag, 2006
Jocelyn E. Krebs, Benjamin Lewin, Elliott S. Goldstein, Stephen T. Kilpatrick; Lewin's Essential Genes, Jones and Bartlett, 2.ª Edição, 2009
S.B. Primrose e R.M. Twyman; Principles of Gene Manipulation and Genomics, Blackwell Publishing, 8.ª Edição, 2011
A.D. Baxevanis, B.F.F. Ouellette; Bioinformatics: a practical guide to the analysis of genes and proteins, John Wiley & Sons, 2005
B.G. Hall; Phylogenetic Trees Made Easy: a How-to Manual, Sinauer Associates, 4.ª Edição, 2011