Disciplina detalhes

Conhecimentos de Base Recomendados

-

Objetivos

Esta UC tem como principais objetivos fornecer aos estudantes uma visão integrada da estrutura e funcionamento dos genomas, tendo em conta os métodos de sequenciação, anotação e análise do funcionamento dos mesmos. Para além disso, no final do semestre espera-se que os estudantes conheçam os métodos mais recentes de análise da expressão genética ao nível do RNA e proteínas, para além de compreenderem o funcionamento celular de forma integrada e global. 

Métodos de Ensino

Esta UC é composta por uma componente teórica e uma componente teórica-prática. A metodologia de ensino na componente teórica baseia-se na exposição oral com projeção de slides em power point, podendo ser complementada por análise de textos científicos; na componente teórica-prática baseia-se na resolução de problemas e realização de tarefas definidas. A plataforma Moodle será usada como repositório de informações, de atividades, ponto de entrega de trabalhos escritos e fórum de discussão.

Estágio(s)

Não

Programa

• Estrutura organizacional de um genoma; Métodos de sequenciação de genomas, Anotação e análise de genomas;


• Estrutura primária dos genomas, mecanismos de evolução dos genomas e filogenia molecular;


• Genómica comparativa. Definição de Genes ortólogos e parálogos;


• Análise da expressão genética à escala do genoma: transcritómica e proteómica; Metodologias experimentais para o estudo da regulação da expressão genética;


• Genómica funcional. Metabolómica, RNómica, metagenómica e outras ómicas;


• Aplicações da Bioinformática na genómica. Algoritmos para alinhamento de sequências, inferência filogenética e análise de dados de Next-Generation Sequencing;


• Introdução à Biologia de Sistemas.

Demonstração de conteúdos

-

Demonstração da metodologia

-

Docente(s) responsável(eis)

-

Métodos de Avaliação

Bibliografia

Hartl,\tD.\t\tand\tBruce\tCochrane; Analysis of\tGenes\tand Genomes, 2017
Jean-Michel\tClaverie\tand\tCedric\t Notredame; Bioinformatics\tFor\tDummies, Wiley, 2006
Mark Sanders; Gene2c\tAnalysis:\tAn\tIntegrated\tApproach, Pearson, 2016. ISBN: :\t9781292092362\t
Griffiths\tAJF,\tWessler\tSR\tet\tal.; An\tIntroduction\tto\tGenetic\tAnalysis, W.\tH.\tFreeman, 2015. ISBN: 978-1-4641-0948 (www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21766/)
\tJi Xiong; Essential\tBioinformatics, Cambridge University Press, 2006
Barry Hall; Phylogene2c\tTrees\tMade\tEasy:\tA\tHow-To\tManual, Sinauer